密接しているポリゴンの前後関係がおかしい

これはポリゴンの前後関係を保持するバッファサイズが小さいためです（このバッファを深度バッファと呼ぶ）。たぶん下のような現象のことだと思います。

靴下と足がほとんど密着している状態（１６ビット）

この深度バッファを環境設定で変更できます。下の図のリストから「Ｄ」の値が大きいものを選択してください。これが深度バッファの精度になります。 また、この設定はすぐに反映されないので、一度ソフトを終了してから再度起動すると有効になります。

ただし、ここに表示されるリストはビデオカードの性能によって変わります。もし、「D16」しかないのであれば、それしか選択できません。「Ｄ」以外の値は今のところ無視して下さい。

ちなみに「D24S8」に設定すると下のようになります。

※ 基本的には、最初から精度の高い深度バッファを使用するようになっています。